Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms