Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARDQ03181 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160 ms