Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 PTR3YFR029W 2037 nt5.02□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 MRH4YGL064C 1686 nt5.02□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 DPH6YLR143W 2058 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 TAF12YDR145W 1620 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YLR446WYLR446W 1302 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 TFC7YOR110W 1308 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 SEC59YMR013C 1560 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 CST9YLR394W 1449 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 DPB4YDR121W 591 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YGL082WYGL082W 1146 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 PXR1YGR280C 816 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 RNR2YJL026W 1200 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 MEI5YPL121C 669 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 ICY2YPL250C 411 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 NOP56YLR197W 1515 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 PRP28YDR243C 1767 nt5.01□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 PDR5YOR153W 4536 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 SAT4YCR008W 1812 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 MRPL9YGR220C 810 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YIL024CYIL024C 570 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 TVP38YKR088C 1014 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 RLP7YNL002C 969 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 HNT3YOR258W 654 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YPR172WYPR172W 603 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 KAR4YCL055W 1008 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 OPT2YPR194C 2634 nt5□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 CAF4YKR036C 1932 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 RDH54YBR073W 2877 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 SWP82YFL049W 1872 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 LOC1YFR001W 615 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 RMR1YGL250W 726 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YHL049CYHL049C 816 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 ATG27YJL178C 816 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YAR075WYAR075W 474 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 IRC21YMR073C 606 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 ATP19YOL077W-A 207 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YOR379CYOR379C 339 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 NIP7YPL211W 546 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YPL278CYPL278C 303 nt4.99□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 SRP1YNL189W 1629 nt4.98□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt4.98□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 VMA21YGR105W 234 nt4.98□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.98□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YAR061WYAR061W 204 nt4.98□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 GLO1YML004C 981 nt4.98□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 MFB1YDR219C 1398 nt4.98□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 ESA1YOR244W 1338 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 RIM21YNL294C 1602 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 PGM2YMR105C 1710 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 MNN4YKL201C 3537 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 MTL1YGR023W 1656 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YCR001WYCR001W 315 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 RMD6YEL072W 696 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 TMA20YER007C-A 546 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 VMA5YKL080W 1179 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 YKL115CYKL115C 393 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 GMC2YLR445W 567 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 POP3YNL282W 588 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 TRF5YNL299W 1929 nt4.97□□□□□ -1.61
GDE1Q02979 THS1YIL078W 2205 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 LTV1YKL143W 1392 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 DIG2YDR480W 972 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 GPP1YIL053W 753 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 YKR011CYKR011C 1062 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 YNL203CYNL203C 612 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 MCA1YOR197W 1299 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 YOR387CYOR387C 621 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 MET12YPL023C 1974 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 YMR221CYMR221C 1515 nt4.96□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 VID22YLR373C 2706 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 OSH2YDL019C 3852 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 SLY41YOR307C 1362 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 RVS161YCR009C 798 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 NSE4YDL105W 1209 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 snR7-SsnR7-S 179 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 BCP1YDR361C 852 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 PIR3YKL163W 978 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 YBL010CYBL010C 843 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 PIN3YPR154W 648 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 SLF1YDR515W 1344 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 EMP47YFL048C 1338 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 KIN3YAR018C 1308 nt4.95□□□□□ -1.62
GDE1Q02979 YPS7YDR349C 1791 nt4.94□□□□□ -1.62
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