Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MUC3AQ02505 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms