Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM3Q01628 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms