Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAP1Q01518 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAP1Q01518 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAP1Q01518 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms