Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms