Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRB1P82279 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRB1P82279 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRB1P82279 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRB1P82279 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRB1P82279 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRB1P82279 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRB1P82279 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRB1P82279 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRB1P82279 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRB1P82279 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRB1P82279 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRB1P82279 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRB1P82279 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRB1P82279 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRB1P82279 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRB1P82279 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRB1P82279 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRB1P82279 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRB1P82279 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRB1P82279 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CRB1P82279 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CRB1P82279 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CRB1P82279 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRB1P82279 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRB1P82279 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRB1P82279 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRB1P82279 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRB1P82279 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRB1P82279 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRB1P82279 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRB1P82279 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRB1P82279 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRB1P82279 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRB1P82279 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRB1P82279 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRB1P82279 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRB1P82279 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRB1P82279 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRB1P82279 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms