Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-21P61565 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms