Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4BP61018 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4BP61018 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4BP61018 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4BP61018 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4BP61018 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB4BP61018 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB4BP61018 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB4BP61018 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB4BP61018 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB4BP61018 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms