Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTBP60709 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTBP60709 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTBP60709 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTBP60709 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTBP60709 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms