Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY3P57055 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY3P57055 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms