Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAG2P55895 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAG2P55895 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAG2P55895 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAG2P55895 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAG2P55895 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAG2P55895 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAG2P55895 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms