Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GDF10P55107 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF10P55107 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF10P55107 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF10P55107 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF10P55107 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF10P55107 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF10P55107 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDF10P55107 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDF10P55107 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDF10P55107 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDF10P55107 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDF10P55107 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDF10P55107 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms