Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATN1P54259 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATN1P54259 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATN1P54259 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATN1P54259 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATN1P54259 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATN1P54259 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATN1P54259 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATN1P54259 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATN1P54259 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATN1P54259 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATN1P54259 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATN1P54259 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATN1P54259 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATN1P54259 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATN1P54259 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATN1P54259 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATN1P54259 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATN1P54259 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATN1P54259 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATN1P54259 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATN1P54259 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATN1P54259 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATN1P54259 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATN1P54259 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATN1P54259 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms