Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC5A3P53794 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms