Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOSBP53539 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOSBP53539 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOSBP53539 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSBP53539 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSBP53539 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSBP53539 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSBP53539 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSBP53539 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSBP53539 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSBP53539 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSBP53539 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSBP53539 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSBP53539 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSBP53539 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSBP53539 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSBP53539 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSBP53539 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSBP53539 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSBP53539 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSBP53539 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSBP53539 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSBP53539 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSBP53539 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSBP53539 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSBP53539 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSBP53539 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSBP53539 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSBP53539 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSBP53539 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSBP53539 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSBP53539 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSBP53539 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSBP53539 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSBP53539 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSBP53539 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms