Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LUMP51884 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LUMP51884 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LUMP51884 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LUMP51884 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LUMP51884 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LUMP51884 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LUMP51884 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LUMP51884 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LUMP51884 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms