Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB27AP51159 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms