Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRE11P49959 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRE11P49959 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRE11P49959 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRE11P49959 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRE11P49959 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRE11P49959 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRE11P49959 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRE11P49959 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRE11P49959 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRE11P49959 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRE11P49959 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRE11P49959 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRE11P49959 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRE11P49959 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRE11P49959 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms