Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK2P49760 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK2P49760 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK2P49760 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK2P49760 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK2P49760 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK2P49760 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK2P49760 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK2P49760 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK2P49760 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK2P49760 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK2P49760 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK2P49760 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK2P49760 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK2P49760 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK2P49760 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLK2P49760 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLK2P49760 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLK2P49760 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLK2P49760 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLK2P49760 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLK2P49760 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLK2P49760 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLK2P49760 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLK2P49760 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK2P49760 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK2P49760 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK2P49760 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK2P49760 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK2P49760 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK2P49760 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK2P49760 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK2P49760 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK2P49760 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK2P49760 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK2P49760 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK2P49760 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms