Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITPNBP48739 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms