Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NMUP48645 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMUP48645 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMUP48645 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms