Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms