Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms