Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNJ1P48048 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms