Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms