Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLC1P35663 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms