Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT9P35527 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT9P35527 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT9P35527 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT9P35527 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT9P35527 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT9P35527 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT9P35527 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT9P35527 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT9P35527 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT9P35527 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT9P35527 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT9P35527 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT9P35527 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT9P35527 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT9P35527 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT9P35527 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT9P35527 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT9P35527 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT9P35527 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT9P35527 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT9P35527 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT9P35527 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT9P35527 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT9P35527 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms