Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA3P35244 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA3P35244 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA3P35244 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA3P35244 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA3P35244 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA3P35244 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA3P35244 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA3P35244 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA3P35244 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA3P35244 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA3P35244 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA3P35244 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA3P35244 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPA3P35244 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA3P35244 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA3P35244 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA3P35244 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA3P35244 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA3P35244 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA3P35244 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms