Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms