Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP1P29466 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP1P29466 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP1P29466 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP1P29466 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP1P29466 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP1P29466 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP1P29466 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP1P29466 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP1P29466 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP1P29466 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP1P29466 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP1P29466 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP1P29466 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP1P29466 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP1P29466 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP1P29466 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP1P29466 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP1P29466 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP1P29466 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP1P29466 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP1P29466 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP1P29466 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP1P29466 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP1P29466 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP1P29466 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP1P29466 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP1P29466 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP1P29466 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP1P29466 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP1P29466 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms