Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD34P28906 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD34P28906 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD34P28906 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD34P28906 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD34P28906 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD34P28906 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD34P28906 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD34P28906 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD34P28906 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD34P28906 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD34P28906 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD34P28906 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD34P28906 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD34P28906 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD34P28906 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD34P28906 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD34P28906 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD34P28906 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD34P28906 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD34P28906 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD34P28906 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD34P28906 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms