Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB3P28472 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB3P28472 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB3P28472 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB3P28472 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB3P28472 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB3P28472 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB3P28472 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB3P28472 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB3P28472 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GABRB3P28472 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB3P28472 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB3P28472 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB3P28472 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms