Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTFP26441 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTFP26441 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTFP26441 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTFP26441 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTFP26441 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTFP26441 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTFP26441 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTFP26441 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTFP26441 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTFP26441 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTFP26441 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTFP26441 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTFP26441 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTFP26441 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTFP26441 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTFP26441 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTFP26441 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTFP26441 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTFP26441 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTFP26441 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTFP26441 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTFP26441 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTFP26441 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms