Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNCP24863 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNCP24863 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNCP24863 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNCP24863 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNCP24863 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNCP24863 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNCP24863 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNCP24863 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNCP24863 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNCP24863 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNCP24863 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNCP24863 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNCP24863 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNCP24863 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNCP24863 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNCP24863 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNCP24863 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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