Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGA6P23229 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms