Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL1P22362 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL1P22362 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL1P22362 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL1P22362 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL1P22362 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL1P22362 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL1P22362 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms