Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2P22307 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SCP2P22307 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCP2P22307 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCP2P22307 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2P22307 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2P22307 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2P22307 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCP2P22307 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCP2P22307 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms