Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms