Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCN1P20061 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCN1P20061 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCN1P20061 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCN1P20061 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCN1P20061 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCN1P20061 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCN1P20061 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCN1P20061 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCN1P20061 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCN1P20061 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCN1P20061 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCN1P20061 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCN1P20061 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCN1P20061 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCN1P20061 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCN1P20061 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCN1P20061 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCN1P20061 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCN1P20061 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCN1P20061 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCN1P20061 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms