Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms