Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms