Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms