Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHBP07195 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHBP07195 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHBP07195 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHBP07195 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHBP07195 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHBP07195 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHBP07195 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHBP07195 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHBP07195 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHBP07195 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHBP07195 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHBP07195 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHBP07195 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHBP07195 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHBP07195 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHBP07195 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHBP07195 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHBP07195 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHBP07195 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHBP07195 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHBP07195 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms