Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGGP02679 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGGP02679 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGGP02679 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGGP02679 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGGP02679 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGGP02679 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGGP02679 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGGP02679 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGGP02679 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGGP02679 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGGP02679 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGGP02679 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGGP02679 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGGP02679 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGGP02679 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGGP02679 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGGP02679 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGGP02679 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGGP02679 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGGP02679 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGGP02679 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGGP02679 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGGP02679 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGGP02679 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGGP02679 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGGP02679 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FGGP02679 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FGGP02679 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGGP02679 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGGP02679 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGGP02679 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGGP02679 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGGP02679 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGGP02679 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGGP02679 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGGP02679 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGGP02679 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGGP02679 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGGP02679 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGGP02679 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGGP02679 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms