Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHDP01880 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHDP01880 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHDP01880 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHDP01880 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHDP01880 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHDP01880 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHDP01880 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHDP01880 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHDP01880 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHDP01880 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHDP01880 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHDP01880 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHDP01880 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHDP01880 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHDP01880 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHDP01880 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHDP01880 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHDP01880 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHDP01880 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHDP01880 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHDP01880 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHDP01880 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHDP01880 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHDP01880 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHDP01880 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHDP01880 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHDP01880 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHDP01880 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHDP01880 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHDP01880 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHDP01880 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
IGHDP01880 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHDP01880 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHDP01880 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHDP01880 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHDP01880 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHDP01880 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHDP01880 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHDP01880 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms