Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13A1P00488 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F13A1P00488 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F13A1P00488 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F13A1P00488 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F13A1P00488 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F13A1P00488 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F13A1P00488 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F13A1P00488 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
F13A1P00488 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
F13A1P00488 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F13A1P00488 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
F13A1P00488 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F13A1P00488 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F13A1P00488 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F13A1P00488 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
F13A1P00488 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F13A1P00488 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
F13A1P00488 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F13A1P00488 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F13A1P00488 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
F13A1P00488 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F13A1P00488 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F13A1P00488 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
F13A1P00488 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F13A1P00488 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F13A1P00488 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F13A1P00488 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F13A1P00488 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F13A1P00488 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F13A1P00488 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F13A1P00488 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F13A1P00488 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F13A1P00488 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
F13A1P00488 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
F13A1P00488 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
F13A1P00488 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F13A1P00488 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
F13A1P00488 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F13A1P00488 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F13A1P00488 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F13A1P00488 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F13A1P00488 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F13A1P00488 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F13A1P00488 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F13A1P00488 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F13A1P00488 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F13A1P00488 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F13A1P00488 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F13A1P00488 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F13A1P00488 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F13A1P00488 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F13A1P00488 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F13A1P00488 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F13A1P00488 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F13A1P00488 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F13A1P00488 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F13A1P00488 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
F13A1P00488 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F13A1P00488 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms