Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms