Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN5O94779 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN5O94779 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms