Protein–RNA interactions for Protein: O76013

KRT36, Keratin, type I cuticular Ha6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT36O76013 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT36O76013 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT36O76013 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT36O76013 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT36O76013 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT36O76013 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT36O76013 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT36O76013 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT36O76013 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT36O76013 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT36O76013 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT36O76013 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT36O76013 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT36O76013 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT36O76013 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT36O76013 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT36O76013 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms